Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp28Q5I043 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp28Q5I043 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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