Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp22Q5DU02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms