Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WhammQ571B6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WhammQ571B6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms