Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prune2Q52KR3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prune2Q52KR3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms