Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spire1Q52KF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms