Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1qtnf9Q4ZJN1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms