Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rimbp3Q3V0F0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rimbp3Q3V0F0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rimbp3Q3V0F0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rimbp3Q3V0F0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms