Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cfap65Q3V0B4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cfap65Q3V0B4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfap65Q3V0B4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms