Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clpsl2Q3UW21 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms