Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn4Q3UV66 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms