Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhdc9Q3USL1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms