Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fchsd2Q3USJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fchsd2Q3USJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms