Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms