Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cog7Q3UM29 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms