Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ell2Q3UKU1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms