Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dtx3lQ3UIR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms