Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc34Q3UI66 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms