Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnrc6cQ3UHC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms