Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc177Q3UHB8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc177Q3UHB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms