Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms