Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Smarca4Q3TKT4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Smarca4Q3TKT4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms