Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp39Q3TIX9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp39Q3TIX9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms