Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fubp3Q3TIX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fubp3Q3TIX6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms