Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Trpm1Q2TV84 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm1Q2TV84 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.4 ms