Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms