Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kndc1Q0KK55 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kndc1Q0KK55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kndc1Q0KK55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms