Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cass4Q08EC4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms