Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tff1Q08423 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tff1Q08423 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tff1Q08423 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tff1Q08423 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tff1Q08423 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tff1Q08423 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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