Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms