Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caprin2Q05A80 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms