Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk16Q04735 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms