Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd1Q04519 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd1Q04519 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms