Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tff2Q03404 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms