Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1sQ02789 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1sQ02789 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1sQ02789 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms