Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1Q02242 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1Q02242 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms