Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sec23aQ01405 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sec23aQ01405 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms