Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2cQ01098 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2cQ01098 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms