Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2bQ01097 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Grin2bQ01097 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2bQ01097 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms