Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Yy1Q00899 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms