Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neo1P97798 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Neo1P97798 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neo1P97798 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Neo1P97798 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Neo1P97798 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Neo1P97798 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neo1P97798 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Neo1P97798 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Neo1P97798 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Neo1P97798 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neo1P97798 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms