Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp1P97309 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms