Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx2P80206 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms