Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1bP70700 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms