Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tp53bp1P70399 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tp53bp1P70399 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms