Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgif1P70284 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgif1P70284 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms