Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp3P70281 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms