Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf6P70196 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf6P70196 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf6P70196 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf6P70196 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf6P70196 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf6P70196 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms