Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf5P70191 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf5P70191 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf5P70191 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms