Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtnP63089 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtnP63089 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtnP63089 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtnP63089 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtnP63089 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtnP63089 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms