Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crabp1P62965 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms